Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb2Q3UUV9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb2Q3UUV9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb2Q3UUV9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb2Q3UUV9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb2Q3UUV9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb2Q3UUV9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb2Q3UUV9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb2Q3UUV9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb2Q3UUV9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb2Q3UUV9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb2Q3UUV9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb2Q3UUV9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb2Q3UUV9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-Eb2Q3UUV9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-Eb2Q3UUV9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms