Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms