Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc102aQ3TMW1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms