Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCSK7Q16549 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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