Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN1Q14699 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN1Q14699 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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