Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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