Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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