Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRQ13535 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRQ13535 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRQ13535 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRQ13535 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRQ13535 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRQ13535 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRQ13535 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRQ13535 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRQ13535 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRQ13535 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRQ13535 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRQ13535 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRQ13535 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRQ13535 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRQ13535 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRQ13535 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRQ13535 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRQ13535 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRQ13535 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRQ13535 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRQ13535 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRQ13535 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRQ13535 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRQ13535 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRQ13535 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRQ13535 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRQ13535 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRQ13535 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRQ13535 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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