Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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