Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Rundc1Q0VDN7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms