Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms