Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms