Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDLBPQ00341 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms