Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Hoxd13P70217 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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