Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P58686 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P58686 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P58686 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P58686 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P58686 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P58686 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P58686 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P58686 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P58686 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P58686 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P58686 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P58686 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P58686 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P58686 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P58686 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P58686 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P58686 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P58686 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P58686 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P58686 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P58686 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P58686 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P58686 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P58686 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P58686 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P58686 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P58686 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P58686 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P58686 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P58686 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P58686 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P58686 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P58686 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P58686 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P58686 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P58686 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P58686 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P58686 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P58686 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P58686 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P58686 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P58686 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P58686 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P58686 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P58686 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P58686 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P58686 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P58686 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P58686 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P58686 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P58686 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P58686 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P58686 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P58686 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P58686 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P58686 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P58686 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P58686 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P58686 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P58686 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P58686 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P58686 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P58686 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P58686 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P58686 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P58686 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P58686 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P58686 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P58686 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P58686 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P58686 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P58686 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P58686 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms