Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LUMP51884 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LUMP51884 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LUMP51884 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LUMP51884 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LUMP51884 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LUMP51884 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LUMP51884 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LUMP51884 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LUMP51884 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LUMP51884 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LUMP51884 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LUMP51884 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LUMP51884 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LUMP51884 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LUMP51884 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LUMP51884 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LUMP51884 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LUMP51884 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LUMP51884 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LUMP51884 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LUMP51884 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LUMP51884 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LUMP51884 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LUMP51884 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LUMP51884 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LUMP51884 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LUMP51884 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LUMP51884 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LUMP51884 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LUMP51884 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LUMP51884 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LUMP51884 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LUMP51884 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LUMP51884 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LUMP51884 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LUMP51884 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LUMP51884 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LUMP51884 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LUMP51884 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LUMP51884 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LUMP51884 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LUMP51884 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LUMP51884 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LUMP51884 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LUMP51884 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LUMP51884 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LUMP51884 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms