Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POU3F4P49335 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POU3F4P49335 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms