Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 ERP1YAR002C-A 660 nt3.41□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 IZH2YOL002C 954 nt3.41□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 TMA16YOR252W 537 nt3.41□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 BMT2YBR141C 1014 nt3.41□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 APN2YBL019W 1563 nt3.41□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 FLO9YAL063C 3969 nt3.41□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 YPS6YIR039C 1614 nt3.41□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 YMR018WYMR018W 1545 nt3.4□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 DET1YDR051C 1005 nt3.4□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 CUE3YGL110C 1875 nt3.4□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.4□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 LSM1YJL124C 519 nt3.4□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YUH1YJR099W 711 nt3.4□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YBR053CYBR053C 1077 nt3.4□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 MEK1YOR351C 1494 nt3.4□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YDR149CYDR149C 708 nt3.39□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YGR219WYGR219W 342 nt3.39□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 AHP1YLR109W 531 nt3.39□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 TAF4YMR005W 1167 nt3.39□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 NDJ1YOL104C 1059 nt3.39□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YPL071CYPL071C 471 nt3.39□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YPR077CYPR077C 372 nt3.39□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 snR42snR42 351 nt3.39□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 PAF1YBR279W 1338 nt3.39□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 CHO2YGR157W 2610 nt3.38□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 TOS8YGL096W 831 nt3.38□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 PAN5YHR063C 1140 nt3.38□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.38□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 RPA43YOR340C 981 nt3.38□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 RAD5YLR032W 3510 nt3.38□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 SET1YHR119W 3243 nt3.38□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 CDC40YDR364C 1368 nt3.38□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 DSF2YBR007C 2211 nt3.38□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 SKN7YHR206W 1869 nt3.37□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 TOP1YOL006C 2310 nt3.37□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 TRM1YDR120C 1713 nt3.37□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 MSS2YDL107W 1056 nt3.37□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 CDC26YFR036W 375 nt3.37□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 BET1YIL004C 429 nt3.37□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YNL013CYNL013C 378 nt3.37□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YOR314WYOR314W 330 nt3.37□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 FLO5YHR211W 3228 nt3.37□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 KTR6YPL053C 1341 nt3.37□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 CTK1YKL139W 1587 nt3.37□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 SIN3YOL004W 4611 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 DTD1YDL219W 453 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 NKP1YDR383C 717 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YFL051CYFL051C 483 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 PEX21YGR239C 867 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 APC9YLR102C 798 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 SPC24YMR117C 642 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 RPC34YNR003C 954 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 TAF14YPL129W 735 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 MCM16YPR046W 546 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 FES1YBR101C 873 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 ABD1YBR236C 1311 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 MEF1YLR069C 2286 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 VPS17YOR132W 1656 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 PHO5YBR093C 1404 nt3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 JJJ1YNL227C 1773 nt3.35□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 MSA1YOR066W 1890 nt3.35□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 GRX6YDL010W 696 nt3.35□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 MCM21YDR318W 1107 nt3.35□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt3.35□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YPT35YHR105W 645 nt3.35□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 RRG9YNL213C 645 nt3.35□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 HRT1YOL133W 366 nt3.35□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 NMD2YHR077C 3270 nt3.35□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 DSL1YNL258C 2265 nt3.35□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 PFK26YIL107C 2484 nt3.34□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 VPS33YLR396C 2076 nt3.34□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YFL040WYFL040W 1623 nt3.34□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YCR007CYCR007C 720 nt3.34□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 MED2YDL005C 1296 nt3.34□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.34□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 DUO1YGL061C 744 nt3.34□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 RPC37YKR025W 849 nt3.34□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 YLR446WYLR446W 1302 nt3.34□□□□□ -1.87
SHQ1P40486 DSN1YIR010W 1731 nt3.33□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 MDM1YML104C 3384 nt3.33□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 QRI7YDL104C 1224 nt3.33□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 IRC6YFR043C 714 nt3.33□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt3.33□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 MDJ2YNL328C 441 nt3.33□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 VAM10YOR068C 345 nt3.33□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 SPS4YOR313C 1017 nt3.33□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 STE23YLR389C 3084 nt3.33□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 MIG1YGL035C 1515 nt3.33□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 STP1YDR463W 1560 nt3.33□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 YSP2YDR326C 4317 nt3.33□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 NTO1YPR031W 2247 nt3.32□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 UBP5YER144C 2418 nt3.32□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 YAK1YJL141C 2424 nt3.32□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 PAM1YDR251W 2493 nt3.32□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 FRQ1YDR373W 573 nt3.32□□□□□ -1.88
SHQ1P40486 SCL1YGL011C 759 nt3.32□□□□□ -1.88
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