Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms