Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPP30301 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPP30301 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPP30301 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPP30301 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPP30301 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPP30301 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPP30301 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPP30301 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPP30301 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPP30301 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MIPP30301 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MIPP30301 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MIPP30301 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIPP30301 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIPP30301 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIPP30301 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIPP30301 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIPP30301 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIPP30301 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIPP30301 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPP30301 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPP30301 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPP30301 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPP30301 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPP30301 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPP30301 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPP30301 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPP30301 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPP30301 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPP30301 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPP30301 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPP30301 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPP30301 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPP30301 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPP30301 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPP30301 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPP30301 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPP30301 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPP30301 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPP30301 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPP30301 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPP30301 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPP30301 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPP30301 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPP30301 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPP30301 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPP30301 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPP30301 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPP30301 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPP30301 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPP30301 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPP30301 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPP30301 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPP30301 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPP30301 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPP30301 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPP30301 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPP30301 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPP30301 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPP30301 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPP30301 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPP30301 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPP30301 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms