Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ntf3P20181 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntf3P20181 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms