Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL6A2P12110 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL6A2P12110 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COL6A2P12110 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL6A2P12110 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL6A2P12110 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL6A2P12110 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL6A2P12110 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL6A2P12110 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL6A2P12110 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL6A2P12110 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL6A2P12110 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL6A2P12110 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL6A2P12110 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COL6A2P12110 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COL6A2P12110 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL6A2P12110 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL6A2P12110 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL6A2P12110 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL6A2P12110 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL6A2P12110 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL6A2P12110 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL6A2P12110 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL6A2P12110 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL6A2P12110 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms