Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAMP11215 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms