Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms