Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UbbP0CG49 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms