Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB6O95452 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB6O95452 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB6O95452 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB6O95452 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB6O95452 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB6O95452 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB6O95452 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB6O95452 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB6O95452 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB6O95452 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB6O95452 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB6O95452 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB6O95452 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB6O95452 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB6O95452 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB6O95452 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB6O95452 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB6O95452 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB6O95452 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB6O95452 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB6O95452 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB6O95452 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB6O95452 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB6O95452 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB6O95452 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB6O95452 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB6O95452 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB6O95452 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB6O95452 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB6O95452 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB6O95452 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB6O95452 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB6O95452 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB6O95452 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB6O95452 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB6O95452 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB6O95452 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB6O95452 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB6O95452 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB6O95452 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB6O95452 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB6O95452 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB6O95452 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB6O95452 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB6O95452 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB6O95452 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB6O95452 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB6O95452 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB6O95452 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB6O95452 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB6O95452 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB6O95452 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB6O95452 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB6O95452 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB6O95452 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB6O95452 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB6O95452 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB6O95452 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB6O95452 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB6O95452 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB6O95452 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB6O95452 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB6O95452 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB6O95452 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB6O95452 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB6O95452 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB6O95452 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB6O95452 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB6O95452 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB6O95452 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB6O95452 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB6O95452 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB6O95452 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB6O95452 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB6O95452 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB6O95452 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB6O95452 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB6O95452 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB6O95452 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB6O95452 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB6O95452 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms