Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JtbO88824 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JtbO88824 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
JtbO88824 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JtbO88824 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JtbO88824 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JtbO88824 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JtbO88824 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JtbO88824 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JtbO88824 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JtbO88824 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JtbO88824 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JtbO88824 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JtbO88824 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JtbO88824 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JtbO88824 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JtbO88824 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
JtbO88824 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JtbO88824 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
JtbO88824 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JtbO88824 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JtbO88824 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JtbO88824 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JtbO88824 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JtbO88824 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JtbO88824 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JtbO88824 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JtbO88824 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JtbO88824 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JtbO88824 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JtbO88824 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JtbO88824 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JtbO88824 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JtbO88824 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JtbO88824 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JtbO88824 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JtbO88824 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
JtbO88824 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JtbO88824 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JtbO88824 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JtbO88824 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JtbO88824 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JtbO88824 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JtbO88824 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JtbO88824 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
JtbO88824 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
JtbO88824 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
JtbO88824 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JtbO88824 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JtbO88824 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
JtbO88824 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JtbO88824 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JtbO88824 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
JtbO88824 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JtbO88824 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JtbO88824 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JtbO88824 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JtbO88824 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JtbO88824 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JtbO88824 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JtbO88824 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JtbO88824 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JtbO88824 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JtbO88824 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JtbO88824 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JtbO88824 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
JtbO88824 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JtbO88824 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JtbO88824 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JtbO88824 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JtbO88824 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JtbO88824 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
JtbO88824 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JtbO88824 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JtbO88824 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
JtbO88824 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
JtbO88824 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
JtbO88824 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
JtbO88824 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JtbO88824 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JtbO88824 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JtbO88824 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JtbO88824 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JtbO88824 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms