Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AurkbO70126 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AurkbO70126 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AurkbO70126 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AurkbO70126 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AurkbO70126 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AurkbO70126 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AurkbO70126 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AurkbO70126 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AurkbO70126 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AurkbO70126 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AurkbO70126 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AurkbO70126 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AurkbO70126 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AurkbO70126 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
AurkbO70126 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AurkbO70126 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AurkbO70126 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AurkbO70126 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AurkbO70126 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AurkbO70126 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AurkbO70126 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AurkbO70126 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AurkbO70126 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AurkbO70126 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AurkbO70126 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms