Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r34G3XA52 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms