Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r58G3X9U3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms