Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms