Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E5RI56 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E5RI56 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E5RI56 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
E5RI56 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E5RI56 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E5RI56 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E5RI56 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E5RI56 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E5RI56 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
E5RI56 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
E5RI56 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E5RI56 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E5RI56 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E5RI56 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E5RI56 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E5RI56 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E5RI56 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E5RI56 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E5RI56 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E5RI56 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.31■■□□□ 1
E5RI56 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E5RI56 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.31■■□□□ 1
E5RI56 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E5RI56 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E5RI56 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E5RI56 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E5RI56 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
E5RI56 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E5RI56 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E5RI56 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E5RI56 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E5RI56 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E5RI56 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E5RI56 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E5RI56 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E5RI56 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E5RI56 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E5RI56 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E5RI56 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E5RI56 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E5RI56 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E5RI56 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E5RI56 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E5RI56 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E5RI56 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E5RI56 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
E5RI56 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
E5RI56 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E5RI56 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E5RI56 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E5RI56 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E5RI56 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E5RI56 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E5RI56 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
E5RI56 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
E5RI56 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E5RI56 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E5RI56 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E5RI56 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E5RI56 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E5RI56 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E5RI56 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E5RI56 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E5RI56 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
E5RI56 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E5RI56 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms