Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930444P10RikD3YUR1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930444P10RikD3YUR1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms