Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4E1Z4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4E1Z4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4E1Z4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4E1Z4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4E1Z4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4E1Z4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4E1Z4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4E1Z4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4E1Z4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4E1Z4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4E1Z4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4E1Z4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4E1Z4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4E1Z4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4E1Z4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4E1Z4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
B4E1Z4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4E1Z4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4E1Z4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4E1Z4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4E1Z4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4E1Z4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4E1Z4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4E1Z4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4E1Z4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4E1Z4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4E1Z4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4E1Z4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4E1Z4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4E1Z4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4E1Z4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4E1Z4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4E1Z4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4E1Z4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4E1Z4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4E1Z4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4E1Z4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4E1Z4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
B4E1Z4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4E1Z4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4E1Z4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4E1Z4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4E1Z4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4E1Z4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4E1Z4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4E1Z4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
B4E1Z4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4E1Z4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4E1Z4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4E1Z4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4E1Z4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4E1Z4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4E1Z4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4E1Z4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4E1Z4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4E1Z4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4E1Z4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4E1Z4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4E1Z4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4E1Z4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4E1Z4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
B4E1Z4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4E1Z4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4E1Z4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4E1Z4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
B4E1Z4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4E1Z4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4E1Z4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4E1Z4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4E1Z4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4E1Z4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
B4E1Z4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4E1Z4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4E1Z4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4E1Z4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
B4E1Z4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4E1Z4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4E1Z4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4E1Z4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4E1Z4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4E1Z4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4E1Z4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms