Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms