Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD3A2A2Y4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD3A2A2Y4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms