Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms