Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00312Q9Y6C7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms