Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNQ9UQP3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNQ9UQP3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms