Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN6Q9UQ52 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN6Q9UQ52 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms