Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARDHQ9UL12 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms