Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP4Q9UGJ1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms