Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAE1Q9UBE0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAE1Q9UBE0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms