Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4R2Q9NY27 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms