Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms