Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB20Q9NX57 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms