Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms