Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Upk3aQ9JKX8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms