Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK42

Pdk2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdk2Q9JK42 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdk2Q9JK42 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdk2Q9JK42 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms