Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms